新生儿房间隔缺损依据缺损的大小、患儿的情况，可以选择不同的治疗方式。如果患者仅仅是房间隔缺损，即新生儿表现为卵圆孔未闭的状态，而且患儿哭闹不发生紫绀，能够正常的哺乳，进行正常的体力活动。这时首选的可以观察。如果B超发现卵圆孔小于3mm的缺损，更要选择长期观察。因为有很大部分卵圆孔未闭的患者，在新生儿期表现为房间隔缺损，随着年龄的增长有自愈的可能性。如果房间隔缺损大于3mm，小于10mm，可以选择介入的治疗。因为介入是创伤小的微创手术，可以通过血管放入伞状封堵器，封堵房间隔缺损，这种方法创伤小、恢复快。如果患儿房缺在10mm以上，同时伴有肺动脉高压，并且有蹲鞠、紫绀的现象，这时要根据患儿的情况选择合适的时机，尽早对患儿进行手术治疗。最终选择的治疗方式，还是要靠心脏外科医生根据患儿不同的情况、病情以及医生熟悉的手术方式来为患儿进行治疗。
