胆管结石发病的原因可为先天性以及后天性因素导致的。先天性的因素主要指胆管先天性发育不良、胆管狭窄,导致胆汁淤积,容易诱发感染,导致胆管结石和胆管炎。临床上多见的病因多为后天性因素导致的,包括胆道的感染以及损伤,胆道蛔虫病等,其中以胆道的感染最为多见,多为消化道的细菌逆行感染导致的,肝脓肿、胰腺炎、阑尾炎等也可诱发,致病菌多为大肠癌细菌,炎症感染导致胆汁的成分异常,胆盐结晶析出形成结石。此外,胆管结石还可继发于胆囊结石,胆道的损伤可为外力损伤,也可为术中操作的损伤,胆管壁的损伤是这种病发生的诱因之一。