母乳性腹泻一般为生理性腹泻,不需要治疗。但是母乳中含有的乳糖较多,乳糖较多主要是在小肠黏膜表面绒毛的顶端乳糖酶的分泌量较少,或者是活性不高,不能完全消化和分解乳汁中的乳糖,部分留在结肠内的乳糖被结肠菌群酵解成乳酸、氢气、甲烷和二氧化碳。乳酸刺激肠壁增加肠蠕动而表现出腹泻,二氧化碳在肠道内产生胀气和增加肠蠕动,粪中由于乳酸的增加是PH值较低。新生儿就会表现为有腹泻、排气多,并且还会表现出腹胀、肠鸣、腹痛等表现,新生儿如果母乳喂养,不影响体重增长,一般状态良好情况不提倡口服用药。若是特别明显的乳糖不耐受的情况,建议口服乳糖酶。