大约有一半的患者有出血的症状,并且伴有疼痛,但常被认为是痔而延误诊断。较大的肿瘤会影响肛门括约肌的功能,表现为肛门失禁,有20%的患者没有任何症状,需要仔细询问病史,尤其是女性患者的生殖器疣和子宫颈瘤病变史,以确定患者的危险因素。临床检查几乎都可以发现肿物,最常见的是基底凹陷边缘隆起的溃疡型肿物,影像学检查对于了解肿瘤的侵犯情况,区域淋巴结转移及远处转移的情况有很大帮助。最常用的是腹部和盆腔的CT检查,PET/CT扫描能够更加敏感的地发现淋巴结转移,早期发现淋巴结转移对于分期及放疗剂量的选择有着重要意义。