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痛经分为原发和继发，原发性痛经是属于功能性，一般没有什么器质性病理变化，经常发生在月经初潮几年，可能和精神因素、体质以及体内的一些细胞因子激素、神经功能紊乱有关。一般过几年会减弱消失，所以不会引起不孕。
但是继发性痛经，也就是后来出现的痛经，而且越来越加重，常常有病理基础，主要是由子宫内膜异位症、子宫腺肌症、盆腔炎等疾病引起，这些都会引起不孕。比如子宫内膜异位症可以通过影响怀孕，从而引起不孕。
比如子宫内膜破坏了卵巢，让卵巢卵子数量减少，损害了卵子质量，影响卵子生长、发育、成熟和破裂。如果影响了输卵管，可能会引起输卵管梗阻，输卵管积水。如果影响了子宫内膜环境，也会影响胚胎着床。因此，子宫内膜异位症患者，大约有40%-50%合并不孕不育。
