小儿原发性膀胱输尿管反流的基本病因与遗传因素、不稳定性膀胱、膀胱输尿管黏膜发育异常等情况有关，具体分析如下：
1、遗传因素
若存在小儿原发性膀胱输尿管反流的家族遗传史，则患病概率相对高于正常人群。
2、不稳定性膀胱
由于不稳定性膀胱易引起膀胱内压力升高，随着时间推移，易对膀胱输尿管瓣膜造成损害，从而导致小儿原发性膀胱输尿管反流。
3、膀胱输尿管黏膜发育异常
由于膀胱输尿管黏膜发育异常导致膀胱和输尿管连接处功能异常，易造成小儿原发性膀胱输尿管反流。
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