诊断小儿原发性膀胱输尿管反流的方法是肾功能检查、超声检查、排尿性核素膀胱造影等，具体分析如下：
1、肾功能检查
通过肾功能检查的方法，根据尿素氮、血肌酐等数值情况，有助于了解肾功能是否存在受损的情况，能够初步了解疾病。
2、超声检查
通过超声检查的方法，能够观察肾脏、膀胱等部位的发育情况，有助于判断上述部位的病变情况。
3、排尿性核素膀胱造影
通过排尿性核素膀胱造影检查的方法，有助于了解是否存在膀胱输尿管反流的情况，可辅助诊断疾病。
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