疱疹性咽峡炎由柯萨奇病毒A组引起，表现为急骤发热、咽痛等，口腔咽峡部有疱疹，经粪-口和呼吸道飞沫传播，病程自限、预后好；手足口病由肠道病毒71型等引起，有发热、口腔及手足臀部皮疹等，传播途径复杂，多数轻症可自愈，少数重症可致严重后果，可通过卫生措施和接种疫苗预防，两者可通过临床表现等诊断。
手足口病：多种肠道病毒均可引起，其中以肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A组16型（CVA16）最为常见。
临床表现方面
疱疹性咽峡炎：
症状表现：主要表现为急骤发热，大多为低热或中度发热，体温一般在37.5-39.5℃之间，伴有咽痛，患儿可出现拒食、流涎等情况。口腔咽峡部会出现疱疹，初为灰白色小丘疹，周围绕以红晕，之后迅速变为疱疹，疱疹破溃后形成溃疡。
好发部位：病变主要集中在口腔咽峡部，如软腭、悬雍垂、扁桃体及扁桃体窝等部位。
年龄及性别差异：各年龄组均可发病，多见于3-10岁儿童，无明显性别差异。
手足口病：
症状表现：发热程度不一，可为低热至高热，体温可超过39℃。口腔内可见疱疹或溃疡，同时手、足、臀部会出现皮疹，皮疹多为斑丘疹、疱疹，疱疹周围可有炎性红晕，疱内液体较少。部分患儿还可能出现咳嗽、流涕、食欲不振等症状，少数重症患儿可出现神经系统、呼吸系统、循环系统等多系统受累的表现，如精神差、嗜睡、易惊、头痛、呕吐、呼吸困难、心率增快等。
好发部位：口腔、手、足、臀部为主要受累部位。
年龄及性别差异：5岁以下儿童多见，尤其是3岁以下儿童发病率较高，同样无明显性别差异。
传播途径方面
疱疹性咽峡炎：主要通过粪-口途径传播，也可通过呼吸道飞沫传播。比如患儿接触了被柯萨奇病毒污染的食物、水等经口感染，或者通过空气中含有病毒的飞沫被吸入而感染。
手足口病：传播途径较为复杂，主要通过密切接触传播，如接触被肠道病毒污染的手、毛巾、玩具、餐具、奶瓶、床上用品等；还可通过呼吸道飞沫传播；饮用或食入被病毒污染的水和食物也可感染。
病程及预后方面
疱疹性咽峡炎：病程具有自限性，一般为1-2周，预后良好，大多数患儿经过对症支持治疗后可痊愈，极少出现严重并发症。
手足口病：大部分患儿为轻症，病程1-2周可自愈。但少数重症患儿病情进展迅速，可导致死亡等严重后果，尤其是EV71感染的重症患儿，可能会出现神经系统后遗症等。对于5岁以下尤其是3岁以下的儿童，由于其免疫系统发育尚不完善，感染后更易发展为重症，需要密切观察病情变化。
诊断方面
疱疹性咽峡炎：主要根据典型的临床表现，如发热、口腔咽峡部疱疹等进行初步诊断，实验室检查可发现白细胞计数正常或轻度升高，病毒分离可明确病原体，但一般临床多根据典型表现诊断。
手足口病：依据流行病学史、临床表现（发热伴手、足、口、臀部皮疹）进行临床诊断，同时可进行实验室检查，如病毒核酸检测、血清学检测等以明确病毒类型，为病情评估和治疗提供依据。
预防方面
疱疹性咽峡炎：
注意个人卫生，教育儿童勤洗手，尤其是在饭前便后；避免儿童接触感染源，如不与患者密切接触；对儿童使用的餐具、玩具等定期进行消毒。
对于托幼机构等集体场所，要加强环境卫生管理，定期对场所进行清洁和消毒。
手足口病：
同样要注重个人卫生，培养儿童良好的卫生习惯；加强托幼机构等集体场所的卫生管理，做好教室、宿舍等场所的通风换气，定期对玩具、用具等进行消毒；在手足口病流行期间，避免带儿童去人群密集、空气流通差的公共场所；另外，EV71疫苗可用于6月龄-5岁儿童预防EV71感染所致的手足口病，可根据儿童年龄等情况接种疫苗进行预防。
