小孩子发烧肚子痛的原因包括感染性和非感染性因素。感染性因素有肠道病毒（轮状、诺如）、细菌（沙门菌、大肠杆菌）感染及呼吸道感染累及胃肠道；非感染性因素包括腹部脏器病变（肠痉挛、肠系膜淋巴结炎）、食物过敏、腹部外伤等，家长需密切观察病情，及时就医并做好护理。
一、感染性因素
（一）肠道感染
1.病毒感染：
轮状病毒感染较为常见，多发生在婴幼儿群体。轮状病毒主要通过粪-口途径传播，患儿除了发烧、肚子痛外，还常伴有腹泻症状，大便多为水样或蛋花汤样。研究表明，轮状病毒感染引起的发热一般为中等度热，体温多在38℃-39℃左右，肚子痛可能是由于肠道炎症刺激肠道平滑肌所致。
诺如病毒感染也可导致小孩子发烧肚子痛，诺如病毒感染的患儿发烧程度不一，部分可出现高热，肚子痛往往较为明显，以脐周疼痛多见，同时可伴有呕吐、腹泻等症状，在学龄儿童和青少年中感染相对较多见，其传播速度较快，在学校、幼儿园等集体场所易暴发流行。
2.细菌感染：
沙门菌属感染，患儿多有进食不洁食物史，除发烧、肚子痛外，腹泻症状较为突出，大便可呈黏液便、脓血便等，肚子痛可能是因为细菌在肠道内繁殖，引起肠道黏膜炎症、水肿，刺激肠道蠕动加快或痉挛。患儿发热可为持续发热或间歇发热，体温可高达39℃以上。
大肠杆菌感染也较常见，尤其是产毒性大肠杆菌，患儿主要表现为发热、腹痛、腹泻，腹泻物多为稀便、水样便，肚子痛原因与肠道炎症导致的肠道功能紊乱有关，发热程度因感染严重程度不同而有所差异。
（二）呼吸道感染累及胃肠道
上呼吸道感染时，病原体产生的毒素等可能会影响胃肠道功能，导致小孩子出现发烧肚子痛的情况。例如，流感病毒引起的上呼吸道感染，除了有发热、咳嗽、流涕等呼吸道症状外，部分患儿可出现恶心、呕吐、肚子痛等胃肠道症状。这是因为病毒感染引起全身炎症反应，影响了胃肠道的正常蠕动和消化功能，从而出现肚子痛，同时机体发热应对感染。
二、非感染性因素
（一）腹部脏器病变
1.肠痉挛：
多见于婴幼儿，可能与饮食因素有关，如进食过快、过饱，摄入过多生冷食物等。小孩子发烧肚子痛可能是肠痉挛引起，疼痛多为阵发性，以脐周为主，疼痛程度轻重不一，可自行缓解，发热一般为低热或中度发热，是机体对可能存在的胃肠功能紊乱等情况的一种反应。
2.肠系膜淋巴结炎：
好发于7岁以下儿童，多与上呼吸道感染有关。患儿常先有发热、咽痛、流涕等上呼吸道感染表现，随后出现肚子痛，疼痛部位以右下腹多见，但不像阑尾炎那样局限，肚子痛是由于肠系膜淋巴结炎症、肿大，刺激周围组织引起。发热多为中等度热，体温在38℃左右，可伴有恶心、呕吐等症状。
（二）其他非感染性因素
1.食物过敏：
如果小孩子对某些食物过敏，如牛奶、鸡蛋等，进食后可能出现过敏反应，表现为发烧、肚子痛，同时可能伴有皮疹、瘙痒等其他过敏症状。发烧程度因人而异，肚子痛是因为过敏引起肠道黏膜水肿、炎症等改变，导致肠道不适。
2.腹部外伤：
如有腹部受到碰撞等外伤史，小孩子可能出现发烧肚子痛，同时可能有腹部局部的红肿、淤血等表现，发热是机体对创伤的一种应激反应，肚子痛则是外伤导致腹部组织损伤、刺激神经引起。不过这种情况相对较少见，但也是需要考虑的非感染性因素之一。
当小孩子出现发烧肚子痛时，家长应密切观察孩子的病情变化，如体温变化、肚子痛的部位、程度、持续时间等，及时带孩子就医，进行相关检查，如血常规、大便常规等，以明确病因，采取相应的治疗措施。对于小孩子，在护理方面要注意保暖，合理饮食，避免食用生冷、不洁食物等。
