丙硫氧嘧啶孕妇在严格评估后可以短期使用，尤其适用于甲亢症状明显且甲巯咪唑不耐受的情况，但需在医生指导下监测副作用。
妊娠早期（前12周）使用丙硫氧嘧啶需谨慎，因可能增加胎儿皮肤发育异常风险，此时优先选择甲巯咪唑，仅在前者过敏或疗效不佳时使用。
妊娠中晚期（13周后）可安全使用丙硫氧嘧啶，其胎盘透过率较低，对胎儿甲状腺影响较小，但需密切监测母体肝功能，因该时期肝损伤风险相对升高。
哺乳期妇女禁用丙硫氧嘧啶，因其乳汁中药物浓度较高，可能影响婴儿甲状腺功能，可选择甲巯咪唑并调整哺乳时间。
特殊人群如合并严重肝肾功能不全者，需避免使用丙硫氧嘧啶，改用手术或放射性碘治疗（孕期禁忌），用药期间应定期复查血常规及甲状腺功能指标。
