连续三星期扁桃体化脓就发烧39度，可能是细菌感染未得到有效控制、免疫力低下、患有其他疾病或治疗不当等原因引起的。
1.细菌感染未得到有效控制：扁桃体化脓是由细菌感染引起的，如果感染未得到及时治疗，细菌可能会继续繁殖，导致炎症加重，从而引起发烧。
2.免疫力低下：如果患者的免疫力低下，如患有免疫缺陷疾病、长期使用免疫抑制剂等，可能会导致细菌感染难以控制，从而引起发烧。
3.其他疾病：除了扁桃体化脓外，患者可能还患有其他疾病，如肺炎、支气管炎等，这些疾病也可能导致发烧。
4.治疗不当：如果患者的治疗方法不当，如使用的药物剂量不足、使用时间不够长等，可能会导致细菌感染未得到有效控制，从而引起发烧。
针对这种情况，建议患者及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定病因，并采取相应的治疗措施。以下是一些建议：
1.就医检查：患者应及时就医，进行血常规、C反应蛋白等检查，以确定感染的严重程度和病因。医生可能还会进行扁桃体分泌物涂片和培养，以确定具体的病原菌，并根据药敏试验结果选择合适的抗生素进行治疗。
2.注意休息：患者应注意休息，避免过度劳累和剧烈运动，保持充足的睡眠。
3.饮食调整：患者应注意饮食调整，多吃富含维生素和蛋白质的食物，如蔬菜、水果、鸡蛋、牛奶等，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物。
4.口腔护理：患者应注意口腔护理，保持口腔清洁，早晚刷牙，饭后漱口。
5.注意体温：患者应注意体温变化，及时采取降温措施，如物理降温、药物降温等，避免体温过高引起惊厥等并发症。
总之，连续三星期扁桃体化脓就发烧39度，可能是由细菌感染未得到有效控制、免疫力低下、其他疾病或治疗不当等原因引起的。患者应及时就医，进行详细的检查和诊断，并采取相应的治疗措施。同时，患者应注意休息、饮食调整、口腔护理和注意体温变化，以促进病情的恢复。
