亚急性感染性心内膜炎有全身感染症状如发热、乏力盗汗；心脏相关症状如心脏杂音、心力衰竭；栓塞症状如脑栓塞、肺栓塞、肾栓塞；还有皮肤黏膜表现如瘀点等及杵状指（趾）等症状，发热是最常见全身感染症状，心脏杂音几乎所有患者可闻及，赘生物脱落可致多种栓塞，皮肤黏膜有相应表现且病程长可现杵状指（趾）。
发热：是最常见的症状，多为持续性低至中度发热，体温一般在37.5~39℃之间，也有部分患者体温可呈弛张性，体温波动较大，波动范围可达2℃以上。约3/4的患者有发热表现，发热的机制主要是由于病原体感染引起机体的免疫反应，导致体温调节中枢功能紊乱。不同年龄、性别患者发热表现可能有一定差异，例如儿童患者发热可能相对更急骤，而老年患者发热可能相对不典型，体温升高幅度较小；女性患者在生理期等特殊时期，发热表现可能受激素水平等影响，但总体仍符合感染性心内膜炎发热的一般特点。生活方式方面，长期熬夜、劳累等可能导致机体免疫力下降，使感染更容易发生且发热表现可能更不典型；有基础病史的患者，如本身有心血管疾病等，发热可能与基础疾病相互影响，加重病情。
乏力、盗汗：患者常感到全身乏力，活动耐力明显下降，稍微活动就会出现疲倦感。夜间盗汗较为常见，表现为睡眠中出汗较多，醒后汗止。这是因为感染导致机体消耗增加，能量代谢紊乱，以及免疫反应的持续存在引起的。
心脏相关症状
心脏杂音：几乎所有患者均可闻及心脏杂音，多是由于心内膜炎导致瓣膜病变，引起血流动力学改变产生杂音。原有心脏杂音的患者，杂音性质可发生改变，出现新的杂音，典型的杂音可为粗糙、呈海鸥鸣样或音乐样的杂音。不同类型的瓣膜受累产生的杂音部位有所不同，如二尖瓣受累时杂音多位于心尖区，主动脉瓣受累时杂音多位于主动脉瓣区等。
心力衰竭：是亚急性感染性心内膜炎的重要并发症之一。随着病情进展，瓣膜损害严重，影响心脏的正常收缩和舒张功能，导致心输出量减少，肺循环和（或）体循环淤血，从而出现心力衰竭的表现，如呼吸困难（劳力性呼吸困难、夜间阵发性呼吸困难等）、端坐呼吸、水肿（双下肢水肿、颜面水肿等）、乏力等。老年人由于心脏储备功能下降，更容易出现心力衰竭且症状可能更隐匿；女性患者在妊娠等特殊生理状态下，心脏负担加重，发生心力衰竭的风险可能增加；有长期高血压、冠心病等基础病史的患者，本身心脏功能已有一定损害，发生感染性心内膜炎后更易诱发心力衰竭。
栓塞症状
脑栓塞：可引起神经系统症状，如头痛、呕吐、偏瘫、失语、意识障碍等。这是由于感染性心内膜炎形成的赘生物脱落，随血液循环进入脑动脉，导致脑动脉栓塞。不同年龄患者脑栓塞表现有所差异，儿童患者脑栓塞可能导致更迅速的神经系统功能损害，因为儿童神经系统发育尚不完善，对缺血缺氧更敏感；老年患者脑栓塞后恢复相对较慢，且容易出现并发症；女性患者在脑栓塞发生时，需考虑与月经周期等可能的影响因素，但主要还是取决于栓塞的部位和程度。
肺栓塞：表现为突然发生的胸痛、咯血、呼吸困难等。赘生物脱落进入肺动脉引起肺栓塞，胸痛多为剧烈的刺痛或绞痛，咯血可为少量痰中带血或大量咯血，呼吸困难表现为呼吸急促、气促等。有吸烟史等不良生活方式的患者，本身肺部血管弹性等可能已有一定影响，发生肺栓塞后病情可能更严重；有肺部基础疾病的患者，如慢性阻塞性肺疾病等，肺栓塞的症状可能被掩盖或加重。
肾栓塞：可出现腰痛、血尿等症状。肾动脉栓塞导致肾脏缺血、缺氧，引起腰痛，血尿则是因为肾脏组织受损，红细胞进入尿液中。
其他症状
皮肤黏膜表现：部分患者可出现瘀点，多见于口腔黏膜、睑结膜、胸前皮肤等部位，为针尖大小的出血点，压之不褪色；也可出现指甲下条纹状出血；还可能有Osler结节，表现为指（趾）垫出现的豌豆大小的红紫色疼痛性结节，多发生于手指或足趾的末端掌面，有压痛；Janeway损害，为手掌和足底出现的无痛性出血红斑，大小约1~4mm。这些皮肤黏膜表现是由于微血管炎或微栓塞引起的。
杵状指（趾）：病程较长的患者可能出现杵状指（趾），表现为手指或足趾末端增生、肥厚，呈杵状膨大。其发生机制可能与慢性缺氧、感染等因素有关。
