胃肠道间质瘤有一定的治愈可能性，但治愈情况取决于多种因素。
一般来说，肿瘤越小，治愈的可能性越大。如果肿瘤位于胃肠道的黏膜下层，且体积较小，通过手术切除后，患者有可能获得长期生存，甚至达到治愈的效果。而如果肿瘤较大，侵犯了周围组织或器官，或者位于一些特殊位置，如食管下端、十二指肠等，手术难度较大，治愈的可能性会相对降低。
此外，胃肠道间质瘤的生物学行为差异较大，根据其恶性程度可分为低危、中危和高危。低危的胃肠道间质瘤恶性程度较低，生长缓慢，转移的可能性较小，通过手术切除后，患者预后较好，治愈的可能性较大。而高危的胃肠道间质瘤恶性程度较高，容易复发和转移，即使进行了手术切除，也需要结合靶向药物治疗等综合治疗手段，治愈的难度较大。
