可从症状表现、实验室检查、病程来初步区分病毒感染与细菌感染，婴幼儿和老年人等特殊人群感染表现不典型需特别留意，病毒感染全身症状相对明显、局部症状轻、热程有自限性，血常规常白细胞正常或低、淋巴细胞高，CRP正常或轻度升高；细菌感染局部炎症表现突出，白细胞常升高、中性粒细胞比例增高，CRP明显升高，细菌感染病程若不抗菌治疗易持续进展，婴幼儿和老年人感染表现不典型需密切观察及进一步检查鉴别。
一、从症状表现初步区分
（一）病毒感染相关症状特点
一般来说，病毒感染引起的发烧，全身症状相对可能更明显，局部症状相对轻一些。例如普通感冒病毒感染导致的发烧，孩子可能会有比较明显的流涕、打喷嚏、咳嗽等上呼吸道卡他症状，但咽喉部红肿等局部炎症表现可能没有细菌感染那么重。而且病毒感染引起的发烧，体温波动相对没有细菌感染那么有规律，可能会有反复，但热程相对有一定自限性，比如常见的幼儿急疹，通常是高热3-5天，热退疹出。
对于肠道病毒感染引起的发烧，可能会伴有腹泻、呕吐等消化道症状，不同病毒感染的具体症状可能有差异，但总体全身症状相对细菌感染来说没有那么以局部严重炎症为主。
（二）细菌感染相关症状特点
细菌感染导致的发烧，往往局部炎症表现比较突出。比如化脓性扁桃体炎，孩子除了发烧外，咽喉部会有明显的红肿、化脓，扁桃体上有黄白色的脓性分泌物；肺炎链球菌引起的肺炎，孩子可能会有咳嗽、咳痰，而且痰液可能比较黏稠，肺部听诊能听到湿啰音等；尿路感染时，孩子可能会有尿频、尿急、尿痛等表现，同时伴有发烧，尿常规检查会发现白细胞等异常。一般细菌感染引起的发烧，体温可能会持续在较高水平，而且如果不进行有效的抗菌治疗，体温不容易自行下降。
二、从实验室检查辅助判断
（一）血常规检查
白细胞计数及分类：
病毒感染时，白细胞总数通常正常或降低，淋巴细胞比例常升高。例如，在常见的病毒性感冒中，血常规检查可见白细胞计数正常或偏低，淋巴细胞百分比增高。
细菌感染时，白细胞总数往往升高，中性粒细胞比例通常会增高。比如化脓性细菌感染引起的肺炎、阑尾炎等，血常规检查显示白细胞总数明显升高，中性粒细胞百分比大幅上升。但需要注意的是，也有特殊情况，比如严重细菌感染时，白细胞可能不升高甚至降低，这常见于新生儿、老年人或机体抵抗力非常低下的患者，需要结合临床综合判断。
C-反应蛋白（CRP）：
病毒感染时，CRP一般正常或轻度升高。
细菌感染时，CRP通常会明显升高。CRP是一种急性时相反应蛋白，细菌感染时，机体受到细菌毒素等刺激，CRP会迅速升高，所以CRP可以作为区分细菌和病毒感染的一个辅助指标，但也不是绝对的，比如一些特殊病毒感染也可能引起CRP明显升高，需要结合临床其他表现综合分析。
三、从病程方面辅助判断
（一）病毒感染病程特点
病毒感染引起的发烧，病程相对有一定的规律性。例如，流感病毒感染引起的发烧，通常病程在1-2周左右，经过积极的抗病毒等对症治疗，体温会逐渐下降，全身症状也会逐步缓解。而且病毒感染引起的发烧，一般在经过对症处理后，体温有自行下降的趋势，即使体温再次升高，也是在一定的病程阶段内波动。
（二）细菌感染病程特点
细菌感染引起的发烧，如果不进行有效的抗菌治疗，病程往往会持续进展。比如肺炎链球菌肺炎，如果没有使用有效的抗生素，孩子的发烧可能会持续不退，咳嗽、咳痰等症状会逐渐加重，甚至可能出现呼吸困难等严重并发症。细菌感染的病程相对病毒感染来说，更需要及时的抗感染治疗来控制病情。
特殊人群需特别注意
（一）婴幼儿
婴幼儿免疫系统发育尚不完善，病毒和细菌感染的表现可能不典型。比如婴幼儿细菌感染时，白细胞升高不明显的情况更常见，这时候不能仅依靠血常规来判断，需要结合孩子的整体情况，如精神状态、是否有呼吸急促、吃奶情况等。如果婴幼儿发烧，精神萎靡，即使血常规提示白细胞不高，也需要警惕细菌感染的可能，因为婴幼儿病情变化快，一旦怀疑细菌感染，需要及时就医，必要时进行进一步的检查，如血培养等，以明确是否存在细菌感染并及时给予相应治疗。
（二）老年人
老年人免疫力低下，病毒和细菌感染后的表现也不典型。老年人病毒感染时，可能发烧程度不一定很高，但全身症状可能较明显，如乏力、食欲减退等；细菌感染时，白细胞升高可能不明显，而且容易出现感染性休克等严重并发症。所以老年人发烧时，需要更加密切观察病情变化，及时进行相关检查，如血常规、降钙素原（PCT）等检查，PCT在细菌感染时升高更明显，对鉴别细菌和病毒感染有一定帮助，同时要注意老年人的基础疾病情况，因为基础疾病可能会影响感染的表现和预后。
