心内膜炎有全身感染症状如发热、寒战，心脏相关症状如心脏杂音、心力衰竭，周围体征如瘀点等，栓塞症状如脑栓塞、肾栓塞、肺栓塞，还有贫血、杵状指（趾）等其他症状，发热是最常见症状几乎所有患者都会出现，儿童发热更急骤波动大老年人不典型，寒战常伴发热，约百分之八十到八十五患者可闻及心脏杂音，心力衰竭是严重并发症，瘀点等见于不同类型心内膜炎，脑栓塞等是常见栓塞表现，多数患者有轻至中度贫血，杵状指（趾）多发生于病程较长患者。
发热：是心内膜炎最常见的症状，几乎所有患者都会出现。体温可呈持续性或间歇性，热度不一，多为低热至中等度热，也可高达39℃以上。不同年龄段患者发热表现可能有差异，儿童患者发热可能更为急骤且体温波动较大；老年人由于机体反应性差，发热可能不典型，体温升高幅度较低。例如，有研究显示，约80%-85%的感染性心内膜炎患者会出现发热症状。
寒战：常与发热相伴出现，患者会突然感觉寒冷，伴有发抖，这是由于病原体感染后引起机体的免疫反应，导致体温调节中枢紊乱，产热增加而出现的表现。
心脏相关症状
心脏杂音：约80%-85%的患者可闻及心脏杂音，是由于感染导致心瓣膜病变，如瓣膜破损、穿孔、赘生物形成等，引起血液湍流产生杂音。原有心脏杂音的患者，杂音性质可发生改变，如变得粗糙、响亮，出现新的杂音也提示可能存在心内膜炎。不同类型的心内膜炎杂音特点有所不同，例如急性感染性心内膜炎患者的杂音往往较粗糙且变化快。
心力衰竭：是心内膜炎的严重并发症之一。由于心瓣膜受损，导致瓣膜关闭不全或狭窄，影响心脏的正常泵血功能，使心脏负荷加重，进而引起心力衰竭。患者可出现呼吸困难（劳力性呼吸困难、夜间阵发性呼吸困难等）、乏力、水肿等表现。老年人本身心脏功能储备较差，发生心力衰竭时症状可能更不典型，可能仅表现为活动耐力下降、下肢水肿等；儿童患者心力衰竭时可能出现喂养困难、呼吸急促等。
周围体征
瘀点：可出现于皮肤、黏膜、睑结膜等部位，呈鲜红色，直径1-4mm，为毛细血管破裂出血所致。多见于急性感染性心内膜炎患者，好发于锁骨以上皮肤、口腔黏膜及睑结膜等处。
指（趾）甲下线状出血：表现为甲床下线状的出血条纹，呈红棕色，通常与微血管炎或微栓塞有关。
Roth斑：为视网膜的卵圆形出血斑，中心呈白色，多见于亚急性感染性心内膜炎，可能与免疫复合物在视网膜血管沉积有关。
Osler结节：为指（趾）垫出现的豌豆大小的红紫色痛性结节，见于亚急性感染性心内膜炎，是由于微栓塞和免疫反应引起。
Janeway损害：主要见于急性感染性心内膜炎，为手掌和足底处直径1-4mm的无痛性出血红斑，是微血管炎或微栓塞的表现。
栓塞症状
脑栓塞：是心内膜炎常见的栓塞表现，可引起神经系统症状，如突发的头痛、偏瘫、失语、意识障碍等。不同年龄患者脑栓塞后的表现有所不同，儿童脑栓塞可能导致惊厥、精神状态改变等；老年人脑栓塞可能与脑血管本身的基础病变叠加，症状可能更复杂，恢复相对较慢。例如，约20%-40%的感染性心内膜炎患者会发生脑栓塞。
肾栓塞：可引起腰痛、血尿等表现，若发生肾梗死，可出现剧烈腰痛、发热等。老年人肾动脉粥样硬化基础上发生肾栓塞时，症状可能不典型，血尿可能较轻或不明显。
肺栓塞：多见于右心感染性心内膜炎，患者可出现胸痛、呼吸困难、咯血等症状。
其他症状
贫血：多数患者有轻至中度贫血，可能与慢性感染导致的骨髓抑制、红细胞破坏增加等有关。老年人由于本身可能存在造血功能减退等情况，贫血可能相对更明显；儿童患者贫血可能影响其生长发育，表现为面色苍白、乏力等。
杵状指（趾）：多发生于病程较长的患者，表现为手指或足趾末端增生、肥厚，呈杵状膨大。其发生机制可能与慢性缺氧、代谢障碍及中毒性损害有关，一般在发病后数周才出现。
