临床上并不存在小脑囊肿最好的治疗方法，可以通过一般治疗、药物治疗、手术治疗等方式控制病情。
1.一般治疗
患者在日常生活中要改善饮食结构，适量进食一些富含膳食纤维素及优质蛋白的食物，三餐合理搭配，保证营养均衡。禁止吸烟及饮酒，适量运动，增强免疫力。
2.药物治疗
小脑囊肿可诱发颅内压增高，患者可以使用复方甘露醇注射液、甘油果糖注射液等药物降低颅内压，若合并癫痫症状时，可以在医生的指导下使用苯妥英钠片、卡马西平片等药物控制癫痫发作。
3.手术治疗
若患者出现不适症状，还可以采取囊肿开窗术、或囊肿切除术等外科手术方式切除囊肿。
