混合性结缔组织病可累及关节、皮肤黏膜、肌肉、心脏、肾脏、肺脏、消化系统、神经系统、血液系统等，患者可出现相应的症状。
1、关节
患者早期可出现关节疼痛、僵硬等症状，部分患者可能会由于炎症导致肿胀、变形、轻微关节破坏。
2、皮肤黏膜
早期表现为手指或者脚趾尖端苍白，随后发红发紫（即雷诺现象），严重者可发生坏疽。部分患者还可出现黏膜溃疡、皮下结节等现象。
3、肌肉
肌肉疼痛为混合性结缔组织病常见类型之一，大多数患者无明确肌无力现象。
4、心脏
患者可能会发生心肌炎，出现劳累性呼吸困难。
5、肾脏
部分患者可出现肾衰竭，表现为恶心、乏力、少尿、水肿等。
6、肺脏
大部分患者发生肺部受累时，在病情早期无症状。随着病情进展，可能会发生间质性肺病，引起干咳、呼吸困难等症状。
7、消化系统
肠道受累时，可引起腹痛、腹胀等。
8、神经系统
少部分患者可出现神经系统受累症状，表现为头痛、癫痫发作等。
9、血液系统
