新生儿眼炎早期经适当的治疗，一般不会发生并发症，但可见到慢性持续性病例反复发作，可有瘢痕形成，导致视力丧失。
衣原体对红霉素类敏感，在无法排除支原体或菌团感染可以选用红霉素。
?一、衣原体结膜炎和肺炎菌首选红霉素，分三次口服，共用十四天。口服困难或者是重症可以静脉用药，全身用药可速清鼻咽部的衣原体。
眼泪中的红霉素也可达到有效的浓度。
二、衣原体结膜炎可局部用0.1%利福平或0.3%诺氟沙星或10%磺胺醋酰钠眼药水滴眼，每日四次。也可用0.5%红霉素眼膏共两周，局部用药不可速清鼻咽部衣原体。
三、阿奇霉素比红霉素吸收好，共服三天。
