小儿急性咽峡炎和疱疹性咽峡炎的区别在于前者除了口腔疱疹外，还可能在咽峡部、软腭、扁桃体等部位出现灰白色疱疹，周围绕以红晕，而后者疱疹多起于一侧，或见于口腔后部，个别患儿软腭上也可出现疱疹，但不累及牙龈。
小儿急性咽峡炎和疱疹性咽峡炎有区别。
小儿急性咽峡炎是一种急性传染性、发热性疾病，是由许多A组柯萨奇病毒，偶尔也有其他肠道病毒，所引起，其特点为疱疹性溃疡性黏膜损害。常见于婴幼儿，临床特征为骤起高热伴有咽喉痛、头痛、厌食，并常有颈，腹和四肢疼痛。在婴儿常发生呕吐和惊厥，起病2日内口腔黏膜出现少数（很少多于12个）小的（直径1~2mm）灰白色疱疹，周围绕以红晕，多见于扁桃体前部，但也可位于软腭，扁桃体，悬雍垂，舌部等，在以后的24小时内水泡破溃变为浅溃疡，直径一般在5mm以下，1~5日内愈合。并发症少见：症状一般7日内消失。在感染后能产生持久的免疫，但A组中其他型病毒或其他肠道病毒也可能引起再次发疹。
疱疹性咽峡炎是柯萨奇A组病毒所致，好发于夏秋季，它是常见的一种具有流行性的病毒性咽炎。临床特征为骤起高热伴有咽喉痛、头痛、厌食，并常有颈，腹和四肢疼痛。疱疹性咽峡炎的病变在口腔后部；如扁桃体、软腭、悬雍垂，很少累及颊黏膜、舌、龈颊黏膜、硬腭、口唇部。起病2日内口腔黏膜出现少数（很少多于12个）小的（直径1~2mm）灰白色疱疹，周围绕以红晕，多见于扁桃体前部，但也可位于软腭，扁桃体，悬雍垂，舌部等，在以后的24小时内水泡破溃变为浅溃疡，直径一般在5mm以下，1~5日内愈合。并发症少见：症状一般7日内消失。
咽峡部疱疹多起于一侧，或见于口腔后部，个别患儿软腭上也可出现疱疹，但不累及牙龈。
