龟头真菌感染由念珠菌等真菌引起，与局部卫生状况不佳、长期使用抗生素致菌群失调相关，表现为龟头红斑、丘疹、伴瘙痒及豆腐渣样分泌物，镜检可发现真菌菌丝或孢子；梅毒由梅毒螺旋体感染，通过性接触、母婴传播等途径，一期有生殖器无痛性硬下疳，二期有全身多样梅毒疹，需梅毒血清学检查来区分确诊。
一、病因差异
龟头真菌感染主要由念珠菌等真菌引起，多与局部卫生状况不佳、长期使用抗生素导致菌群失调等因素相关；而梅毒是由梅毒螺旋体感染所致，主要通过性接触传播，也可经母婴传播等途径感染。
二、临床表现区别
龟头真菌感染：患者龟头部位常出现红斑、丘疹，可伴有瘙痒感，部分患者局部有白色分泌物，呈豆腐渣样，一般无硬下疳等梅毒特征性表现。
梅毒：一期梅毒表现为生殖器部位无痛性的硬下疳，边界清晰、表面清洁；二期梅毒可出现全身多部位的梅毒疹，皮肤黏膜损害多样，与龟头真菌感染的表现有明显不同。
三、实验室检查不同
龟头真菌感染：取病变部位分泌物进行镜检，可发现真菌菌丝或孢子，以此明确真菌感染的诊断。
梅毒：需进行梅毒血清学检查，如快速血浆反应素试验（RPR）可用于筛查，梅毒螺旋体颗粒凝集试验（TPPA）等用于确诊，通过这些检查能区分是否为梅毒感染。
