肾盂肾炎反复发烧主要因感染未有效控制，致病菌持续存在致机体免疫反应引发，治疗不规范、儿童免疫系统不完善、老年有基础疾病、存在泌尿系统解剖结构异常等都会导致反复发烧。
对于儿童患者，由于其免疫系统发育尚不完善，肾盂肾炎时更容易出现病原体清除不彻底的情况，从而导致反复发烧。而且儿童在患病期间，身体抵抗力较弱，感染容易扩散，也会加重反复发烧的状况。对于老年患者，可能存在基础疾病，如糖尿病等，这会影响机体的免疫功能和抗感染能力，使得肾盂肾炎的治疗难度增加，更容易出现反复发烧的现象。此外，一些患者可能存在泌尿系统的解剖结构异常，如尿路结石、尿路畸形等，这会阻碍尿液的正常排出，使得病原体难以被清除，也是导致肾盂肾炎反复发烧的重要因素。
