假性尖锐湿疣具体引起原因未完全明确，一般认为可能与生理变异、慢性炎症刺激、局部卫生状况相关，生理变异是部分学者认为的正常生理结构，慢性炎症刺激如阴道、宫颈炎症长期刺激可致黏膜增生变化，不良局部卫生状况致局部滋生病原体刺激黏膜可能促发相关组织变化。
生理变异：部分学者认为假性尖锐湿疣是一种正常的生理变异，可能与局部黏膜的生理结构有关。例如，女性的小阴唇内侧可能存在一些正常的组织增生表现，在外观上可能被误认为是异常的病变，但实际上是一种生理性的改变，这种情况在年轻女性中相对常见，可能与个体的生理发育特点有关，不同的个体可能存在不同的黏膜组织状态。
慢性炎症刺激：长期的慢性炎症刺激可能是诱发假性尖锐湿疣的一个因素。比如，女性的阴道炎症、宫颈炎症等，由于炎症的长期刺激，局部黏膜组织可能会出现增生、变化。例如，阴道的慢性炎症会导致局部的黏膜处于一种持续的应激状态，进而可能引起组织的异常增生，这种增生在外观上可能表现为类似假性尖锐湿疣的形态。不同年龄阶段的女性都可能受到炎症因素的影响，而如果本身存在一些基础的妇科炎症性疾病，就会增加发生假性尖锐湿疣的可能性。
局部卫生状况：不良的局部卫生状况也可能与假性尖锐湿疣的发生有一定关联。如果不注意外阴的清洁，局部容易滋生细菌、真菌等病原体，长期的局部环境不佳可能会对黏膜组织产生刺激，从而影响黏膜的正常状态。例如，一些女性不经常更换内裤，或者不注意外阴的清洗，导致局部污垢积聚，刺激局部黏膜，可能会促使假性尖锐湿疣相关的组织变化发生。不同生活方式的人群，如卫生习惯较差的人群，相对更容易受到局部卫生状况不良的影响，进而增加假性尖锐湿疣的发生风险。
