尖锐湿疣与假性湿疣在外观表现、发病部位特征、醋酸白试验及病理检查上有不同。尖锐湿疣初起为细小淡红色丘疹，渐增大增多呈乳头样等，好发于生殖器及肛门等与性行为接触部位，醋酸白试验多阳性，病理见表皮乳头瘤样增生、有挖空细胞；假性湿疣主要在女性外阴小阴唇内侧等，损害为小丘疹，醋酸白试验阴性，病理见黏膜上皮轻度增生、无挖空细胞。
假性湿疣：主要发生在女性外阴，尤其是小阴唇内侧和阴道前庭。损害为1-2毫米大小的丘疹，淡红色，群集但不融合，表面光滑似鱼子状或绒毛状，触之有颗粒感。一般无自觉症状，少数人可能有轻度瘙痒。其发生与生理变异或阴道白色念珠菌感染等有关，与年龄、生活方式等关系相对不似尖锐湿疣与不洁性生活关联紧密，各年龄段女性均可出现，但多见于性活跃期女性，不过并非由性传播引起。
发病部位特征
尖锐湿疣：男性多见于龟头、冠状沟、包皮系带、尿道口、阴茎部、会阴等；女性多见于大小阴唇、阴道口、阴蒂、阴道、宫颈、会阴及肛周等。其发病部位的分布与性行为接触部位密切相关，性生活时皮肤黏膜之间的摩擦等因素易导致病毒感染定植。
假性湿疣：局限于女性外阴，主要集中在小阴唇内侧和阴道前庭，是相对局限于特定部位的良性病变表现，与性行为的直接接触部位关联不似尖锐湿疣紧密，更多与局部的生理状况等有关。
醋酸白试验
尖锐湿疣：用3%-5%醋酸溶液涂抹或湿敷患处，3-5分钟后，若患处变为白色，则为醋酸白试验阳性，这是因为人乳头瘤病毒（HPV）感染后产生的角蛋白与正常组织不同，被醋酸凝固变白。但该试验有一定假阳性可能，比如局部有炎症等情况也可能出现假阳性。不同年龄、性别患者都可能出现该试验阳性结果，但有不洁性生活史者更需结合其他检查综合判断。
假性湿疣：醋酸白试验通常为阴性，涂抹醋酸溶液后不会出现变白的现象。这是由于其组织病理与尖锐湿疣不同，不会出现HPV感染相关的特征性改变。各年龄段女性均可进行该试验辅助鉴别，但需结合其他表现综合分析。
病理检查
尖锐湿疣：病理检查可见表皮呈乳头瘤样增生，棘层肥厚，有挖空细胞，这是HPV感染的特征性细胞改变。挖空细胞体积较大，核大深染，核周有透亮晕。通过病理检查可以明确诊断，不同年龄、性别患者只要有尖锐湿疣病变都可通过病理检查确诊，对于不典型病例病理检查尤为重要。
假性湿疣：病理表现为黏膜上皮轻度增生，棘层正常或轻度肥厚，无挖空细胞。其组织学特征与尖锐湿疣有明显区别，通过病理检查能清晰区分两者，各年龄段女性均可进行病理检查来鉴别，是较为可靠的鉴别方法之一。
