神经官能症药物治疗依具体症状选药，抗焦虑药有苯二氮类和5-羟色胺再摄取抑制剂等，抗抑郁药有选择性5-羟色胺再摄取抑制剂、5-羟色胺和去甲肾上腺素再摄取抑制剂等，β受体阻滞剂对伴有心悸等躯体症状者可能有帮助，儿童优先非药物干预必要用药需谨慎，特殊人群如肝肾功能不全者用药需调量并监测相关指标及不良反应。
抗焦虑药物：
苯二氮类：如阿普唑仑等，具有抗焦虑、镇静催眠作用，可缓解神经官能症患者的焦虑、紧张等情绪，但长期使用可能产生依赖，老年人使用时需注意认知功能等方面的影响，需从小剂量开始使用，根据病情调整剂量。
5-羟色胺再摄取抑制剂（SSRI）：如帕罗西汀等，这类药物不良反应相对较少，耐受性较好，对不同性别患者均可使用，但可能会引起胃肠道不适等反应，用药过程中需关注患者胃肠道症状及情绪变化等情况。
抗抑郁药物：
选择性5-羟色胺再摄取抑制剂：如舍曲林等，对于伴有抑郁情绪的神经官能症患者适用，不同性别患者均可使用，可能会出现性功能障碍等不良反应，需要密切观察患者用药后的反应，尤其是有基础心血管疾病的患者需注意药物对心血管系统的影响。
5-羟色胺和去甲肾上腺素再摄取抑制剂（SNRI）：如文拉法辛等，对多种神经官能症相关症状有一定疗效，使用时需注意血压等变化，老年人使用时要考虑肝肾功能等因素，根据个体情况调整剂量。
β受体阻滞剂：如普萘洛尔等，对于神经官能症伴有心悸等躯体症状的患者可能有一定帮助，不同性别患者均可使用，但哮喘患者等禁用，使用过程中需监测心率等情况。
对于儿童神经官能症患者，应优先考虑非药物干预，如心理治疗等，一般不轻易使用药物，若必须用药需极其谨慎，严格评估风险收益比。特殊人群如肝肾功能不全者，在用药时需调整药物剂量，因为药物的代谢和排泄会受到影响，要密切监测肝肾功能指标以及药物的不良反应。
