肝内胆管结石患者的症状因结石位置、大小、阻塞程度及并发症不同存在差异，主要表现为腹痛、黄疸、发热、消化道症状及肝功能异常，部分患者可长期无症状。
1.腹痛：多为右上腹或肝区隐痛、胀痛，可因结石阻塞胆管致胆汁淤积或炎症刺激引发，疼痛性质可为持续性或阵发性，部分放射至右肩背部或腰部，常在进食油腻食物、劳累后加重，少数患者疼痛剧烈伴恶心呕吐，老年患者疼痛可能不典型，易被忽视。
2.黄疸：结石阻塞肝内胆管时，胆红素排泄受阻，出现皮肤、巩膜黄染，尿色加深呈茶色，大便颜色变浅（陶土色），部分伴皮肤瘙痒，黄疸程度与梗阻范围相关，完全梗阻者黄疸明显，儿童患者因胆红素代谢特点，黄疸出现较早且可能伴尿色异常加重。
3.发热：结石继发胆管炎时，细菌感染引发寒战、高热（体温≥38.5℃），部分患者呈弛张热或稽留热，体温波动大，持续数小时至数天，老年及糖尿病患者感染中毒症状重但体温升高不明显，需结合血常规、C反应蛋白等指标综合判断。
4.消化道症状：胆汁排泄障碍影响消化功能，表现为食欲减退、厌油腻，进食后腹胀、恶心，儿童患者长期进食差可导致营养不良、生长发育迟缓，女性患者因雌激素影响胆汁成分，症状可能随月经周期波动。
5.肝功能异常：反复梗阻或炎症可致肝细胞损伤，ALT、AST等转氨酶升高，严重时胆红素、ALP、GGT升高，长期损害可进展为肝硬化、门脉高压，糖尿病患者因胰岛素抵抗加重肝细胞代谢负担，肝功能异常更显著，儿童患者可出现凝血功能障碍（如牙龈出血、皮下瘀斑）。
