克罗恩病有消化系统表现，如腹痛多在右下腹或脐周间歇性发作，腹泻常见，腹部包块约10%-20%患者可出现，有瘘管形成且肛周病变常见；全身表现包括发热、营养障碍、关节炎、眼部病变、皮肤表现；还有肠外表现，如肝胆病变、肾脏结石等，这些表现会影响不同年龄段儿童的生长发育、活动、心理、视力、皮肤外观等多方面。
腹泻：是常见症状，粪便多为糊状，一般无脓血和黏液，但病变累及结肠下段或直肠时，可有黏液血便。腹泻频率因病情轻重而异，轻者每日2-3次，重者可达每日10余次，儿童长期腹泻可能导致营养不良、生长迟缓。
腹部包块：约10%-20%的患者可出现腹部包块，多位于右下腹与脐周，由肠粘连、肠壁增厚、肠系膜淋巴结肿大、内瘘或局部脓肿形成所致。包块质地中等，有压痛，边界多不清楚，儿童腹部包块可能影响其腹部外观及心理状态。
瘘管形成：是克罗恩病的特征性临床表现，分为内瘘和外瘘。内瘘可通向其他肠段、膀胱、输尿管、阴道等，外瘘则是肠管与体表皮肤相通，外瘘口常有肠内容物排出，儿童发生瘘管可能影响其活动和生活质量，且增加感染风险。
肛周病变：包括肛周脓肿、肛瘘、肛裂等，是克罗恩病常见表现之一，尤其多见于年轻患者，肛周病变可导致疼痛、排便困难等，影响儿童的排便功能和心理。
全身表现
发热：可为低热或中度热，呈间歇性发作，少数患者表现为高热。发热与肠道炎症活动及继发感染有关，儿童发热可能影响其精神状态和学习生活。
营养障碍：由于慢性腹泻、食欲减退及肠道吸收功能障碍等，患者可出现体重减轻、贫血、低蛋白血症、维生素缺乏等营养缺乏表现。儿童长期营养障碍会严重影响生长发育，导致身高、体重低于同龄人，出现发育迟缓等情况。
关节炎：部分患者可出现外周关节炎，以大关节受累为主，呈非对称性、游走性，可伴有肿胀和疼痛。儿童关节炎可能影响其肢体活动，对运动和日常活动造成限制。
眼部病变：如葡萄膜炎、虹膜炎等，表现为眼部疼痛、发红、视物模糊等，儿童眼部病变可能影响其视力和学习。
皮肤表现：可见结节性红斑、坏疽性脓皮病等，结节性红斑多见于下肢，表现为红色疼痛性结节；坏疽性脓皮病可出现皮肤溃疡，儿童皮肤表现可能影响其皮肤外观和心理。
肠外表现
肝胆病变：可出现脂肪肝、胆管周围炎等，少数患者发生原发性硬化性胆管炎，儿童肝胆病变可能影响其肝脏功能和生长代谢。
肾脏结石：可能与患者尿钙排泄增加有关，儿童肾脏结石可能引起腰痛、血尿等症状，影响泌尿系统健康。
