克罗恩病的治疗包括药物治疗、手术治疗和营养治疗。药物治疗有氨基水杨酸制剂、糖皮质激素、免疫抑制剂、生物制剂；手术治疗适用于完全性肠梗阻等情况，方式有病变肠段切除等；营养治疗包括要素饮食和肠内营养，要素饮食用于病情轻或缓解期维持，肠内营养对儿童患者可能是首选。
糖皮质激素：是活动期患者的常用药物，具有强大的抗炎作用。适用于对氨基水杨酸制剂疗效不佳的中度及重度患者，以及急性暴发型患者。如泼尼松等，能迅速缓解症状，但长期使用可能会带来较多副作用，需密切监测。
免疫抑制剂：用于对激素治疗无效或依赖的患者，以及布病处于缓解期需长期维持治疗的患者。常见的有硫唑嘌呤、巯嘌呤等，这类药物起效相对较慢，但可以减少激素的用量并维持病情的缓解。
生物制剂：对于传统治疗无效、有并发症或难以耐受传统药物的患者有较好疗效。例如英夫利西单抗等，通过特异性地阻断炎症介质发挥作用，但价格相对较高，且可能增加感染等风险。
手术治疗
手术指征：当出现完全性肠梗阻、瘘管与脓肿形成、急性穿孔或不能控制的大量出血等情况时，通常需要手术治疗。另外，对于经内科治疗无效、病情反复发作影响生活质量的患者，也可考虑手术。
手术方式：包括病变肠段切除、肠吻合术等。手术需要充分评估患者的整体情况，因为克罗恩病具有复发倾向，术后仍有较高的复发几率。
营养治疗
要素饮食：适用于病情较轻或处于缓解期的维持治疗。要素饮食可以提供人体所需的营养物质，同时减轻肠道负担，有助于炎症的消退。对于儿童患者，要素饮食可能是一种重要的治疗手段，因为它可以在保证营养供应的同时，让肠道得到休息。
肠内营养：对于儿童克罗恩病患者，肠内营养有时可以作为首选治疗方法，它不仅能提供营养，还可能调节肠道免疫功能，缓解肠道炎症。
