双侧卵巢囊肿切除后自然怀孕可能性显著降低，但通过保留部分卵巢组织或辅助生殖技术（如试管婴儿），仍有生育可能。
双侧卵巢囊肿切除后，卵巢组织保留程度是关键。若手术中切除范围较大，剩余卵巢组织不足，可能导致排卵障碍和激素分泌不足，自然受孕难度增加。术前需明确囊肿性质（如良性/恶性），术中尽量保留健康卵巢组织以维持功能。
术后需评估卵巢储备功能。通过检测抗苗勒氏管激素（AMH）、窦卵泡数及基础性激素水平，判断剩余卵巢组织是否具备排卵潜力。若卵巢功能下降明显，建议尽早规划生育方案。
辅助生殖技术是主要选择。对自然受孕困难者，可考虑试管婴儿（IVF）结合胚胎冷冻技术，利用术后剩余卵子或提前冻存的卵子完成受孕。术前需排查子宫环境及其他不孕因素，提高成功率。
特殊人群需个体化评估。年龄＞35岁者卵巢储备降低，建议术前冷冻卵子；合并糖尿病、甲状腺疾病等基础病者，需先控制病情；术后注意营养与内分泌调理，避免感染影响恢复。
