怀孕初期自然流产（妊娠12周内）主要与胚胎染色体异常、母体健康状态、环境因素及免疫调节失衡相关，其中胚胎染色体异常是最常见原因。
一、胚胎染色体异常
约50%-60%早期自然流产由胚胎染色体异常导致，包括父母遗传物质缺陷（如染色体平衡易位）或胚胎分裂过程中染色体不分离，多数为偶发性，与母亲年龄相关（≥35岁风险升高），且35岁以上女性因卵子质量下降，异常核型概率增加。
二、母体内分泌与免疫因素
内分泌紊乱（甲状腺功能减退/亢进、黄体功能不全致孕酮不足）可影响胚胎着床；自身免疫性疾病（抗磷脂综合征、系统性红斑狼疮）或同种免疫异常（母体对胚胎免疫耐受不足），会引发胎盘炎症反应，破坏胚胎生长环境。
三、母体解剖与感染因素
子宫结构异常（如子宫肌瘤、宫腔粘连、宫颈机能不全）影响胚胎着床空间；生殖道感染（衣原体、支原体上行感染）或全身性感染（TORCH综合征）可通过炎症刺激子宫收缩，增加流产风险，尤其衣原体感染与早孕期流产相关性显著。
四、环境与生活方式因素
长期接触甲醛、苯等化学物质、辐射或吸烟、酗酒、过量咖啡因摄入，会通过氧化应激或免疫抑制干扰胚胎发育；过度劳累、长期焦虑抑郁或营养不良（如缺铁性贫血）也可能间接增加流产风险。
五、母体基础疾病与特殊人群
孕妇合并严重感染（如肺炎、肾盂肾炎）、未控制的高血压/糖尿病、严重贫血时，流产风险升高。高龄（≥35岁）、有反复流产史者需加强孕前检查（染色体、甲状腺功能筛查）及孕期监测（孕酮、HCG动态评估），降低流产风险。
