肛裂手术治疗的核心指征为慢性反复发作、保守治疗无效、合并严重并发症或剧烈疼痛影响生活质量，尤其适用于病程超过8周且规范保守治疗2-4周无效的患者。
慢性肛裂病程超8周：慢性肛裂指裂口持续超过8周未愈合，反复炎症刺激致裂口纤维化、边缘变硬，保守治疗（如温水坐浴、外用痔疮膏）难以逆转组织纤维化，临床研究显示此类患者单纯保守治疗有效率不足20%，需手术松解病变组织促进愈合。
合并器质性并发症：若肛裂伴随哨兵痔（前哨痔）、肛乳头肥大、皮下瘘管等，单纯药物无法解决解剖结构异常，手术可同期处理原发病变及并发症，临床数据表明合并并发症者保守治疗复发率超60%，手术能显著降低复发风险。
疼痛剧烈影响生活质量：急性肛裂疼痛持续超1周未缓解，或慢性肛裂疼痛呈持续性、刀割样，经硝酸甘油软膏、止痛药物治疗后疼痛仍无法控制，甚至影响睡眠、工作及排便功能，手术可快速阻断疼痛恶性循环，改善生活质量。
特殊人群愈合困难：糖尿病、老年患者、免疫功能低下者愈合能力差，即使短期规范保守治疗（如1：5000高锰酸钾坐浴、外用促愈药物），裂口仍反复破溃，临床观察此类患者保守治疗平均需3-6个月，手术可缩短至1-2个月愈合。
规范保守治疗无效：急性肛裂经2-4周规范保守治疗后无改善，或慢性肛裂反复发作、裂口无明显缩小，应及时手术，防止病情慢性化，避免裂口纤维化、狭窄等后遗症，早期手术可降低手术难度及创伤。
