肛门尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起的性传播疾病，而痔疮是常见的肛肠疾病，两者病因、症状等方面有区别。
首先看外观，肛门尖锐湿疣通常是单个或多个淡红色小颗粒，逐渐增多变大，形态多样，如菜花状、乳头状等。而痔疮一般是暗红色柔软的团块，有时在排便后可脱出肛门外。其次，肛门尖锐湿疣常伴有瘙痒、灼痛等不适，且容易复发。痔疮主要表现为便血、疼痛、脱出等，便血多为鲜红色，排便时点滴而下或喷射而出。再者，肛门尖锐湿疣通过性接触传播风险较高，而痔疮多与久坐、便秘等因素有关。
从发病原因来说，肛门尖锐湿疣是感染了特定病毒所致，而痔疮是由于肛管或直肠下端静脉丛充血或瘀血并肿大引发。在治疗上，肛门尖锐湿疣需要抗病毒等针对性治疗，而痔疮可通过保守治疗如坐浴、涂抹药膏等缓解症状，严重时才考虑手术。
另外，肛门尖锐湿疣的病变部位多在肛门周围皮肤及黏膜交界处，而痔疮的发病部位主要在肛管齿状线上下。而且肛门尖锐湿疣的病程相对较长，治疗相对复杂，痔疮经过规范治疗多数可缓解。
