牙根囊肿的治疗以手术切除为主，需结合影像学检查明确囊肿范围，术后定期复查。
根尖周囊肿：首选根管治疗，清除感染牙髓后填充根管，促进炎症吸收。适用于年轻恒牙，可保留患牙功能。
始基囊肿：手术完整摘除囊壁，防止复发。若囊肿较大影响邻牙，需同期进行正畸或修复治疗。
含牙囊肿：拔除病源牙并完整刮除囊壁，避免损伤恒牙胚。术后需观察邻牙萌出情况。
角化囊肿：手术彻底刮除并辅助烧灼囊壁，降低复发率。需长期随访，监测颌骨变化。
特殊人群注意：儿童患者需评估囊肿对颌骨发育影响，必要时分期手术；孕妇需权衡治疗时机，优先保守观察；糖尿病患者需控制血糖后再行手术，降低感染风险。
