大豆磷脂的副作用较少，多数人耐受性良好，但部分人群可能出现胃肠道不适、过敏反应或出血风险增加等情况。
胃肠道不适：部分人服用后可能出现腹胀、腹泻、恶心等症状，尤其初次服用或过量使用时更易发生，通常随剂量调整或适应后缓解。
过敏反应：对大豆或磷脂过敏者可能出现皮疹、瘙痒、呼吸困难等过敏症状，需立即停用并就医。
出血风险：长期大量服用可能影响凝血功能，增加出血倾向，如牙龈出血、皮肤瘀斑，有出血性疾病或正在服用抗凝药物者需谨慎。
特殊人群注意：孕妇、哺乳期女性及儿童应在医生指导下使用；老年人若有肝肾功能不全，需注意剂量控制，避免加重代谢负担。
