部分患者咽喉疼也会出现不同程度的耳朵疼，因为咽喉和耳朵是想通的，当咽喉症状缓解后，耳朵不适也会相应缓解，咽鼓管将人的耳朵和咽喉相连通，如果闭上嘴巴，用手捏住鼻子再用力向外呼气，会明显的感觉到耳朵有点胀，是由于咽鼓管相通导致的结果。咽喉疼、耳朵疼一般考虑是咽炎引起的放射性疼痛，由于咽痛逐渐加剧，随炎症侵及的部位，可引起相应的症状。当咽侧索发炎时引起耳痛，如果舌根淋巴组织发炎，则有剧烈的灼痛或刺痛，并可向两耳放射。如果炎症波及咽鼓管时，则出现耳闷、耳鸣及重听等现象。咽喉疼、耳朵疼，还可能是急性中耳炎的症状表现，由于咽部、鼻部的炎症波及咽鼓管，咽鼓管、咽口及管腔黏膜出现充血、肿胀，纤毛运动发生障碍，引起中耳炎，以致出现于耳痛、耳道流脓等常见症状为主的局部炎症性疾病。扁桃体发炎时，因为内耳朵某一部位的神经与人体其他部位有着广泛的联系，如舌咽神经，既有分支到中耳，也有分支到扁桃体、咽喉和舌，如感冒后，扁桃体发炎引起淋巴结肿大，可引起嗓子疼痛不适。局部炎症的刺激，可放射到耳部，引起耳部疼痛。如果过度掏耳朵，由于耳朵与咽喉通过咽鼓管相通，掏耳不当导致耳朵局部感染，影响到了咽鼓管，也会造成咽喉咳嗽、疼痛不适。
