原发性肝癌从病理上可以分为肝细胞性肝癌、胆管细胞性肝癌以及两者的混合型，其中以肝细胞性肝癌最为多见，约占原发性肝癌的90%以上。癌细胞排列呈实性团块，周围附有扩张的血窦，癌细胞大小较为一致，核单个，类圆形，异型性不明显，核分裂象较为少见。而胆管细胞性肝癌是发生在肝内胆管，也就是左右肝管第一级肝内分支以上的恶性肿瘤。组织学表现为腺样分化或者伴随黏液分泌，富含纤维性间质。两者的临床表现一般没有显著的差异，不过肝细胞性肝癌和胆管细胞性肝癌在影像学上还存在一定的不同，特别是在增强CT或核磁共振。不过最重要的是，肝细胞性肝癌甲胎蛋白很有可能表现出显著的升高，但是胆管细胞性肝癌病人，甲胎蛋白很有可能正常，也有利于两者的鉴别诊断。无论是肝细胞性肝癌，还是胆管细胞性肝癌，手术仍然是现阶段效果最好的治疗方案，但是相比于胆管细胞性肝癌，肝细胞性肝癌还可以考虑术后进行肝动脉栓塞化疗，可以进一步降低原发性肝癌的复发率。还有一点需要注意的是，肝细胞性肝癌可以考虑进行肝移植，而胆管细胞性肝癌进行肝移植的效果欠佳，现阶段并不建议。
