大部分内生性软骨瘤属于良性的肿瘤，恶变的可能性比较小。但是确实有些部分内生性软骨瘤会产生恶变，这种情况需要注意以下几点：第一，就是多见于多发的内生性软骨瘤病，这种情况不是一个单纯的膨胀性生长的软骨瘤，一般都会有多发，在外观就有表现。第二，检查生长也比较快，很容易导致骨折或者多在儿童或者比较小的幼儿表现出。这种情况，如果比较严重都需要进行切除和进行病理检查。在病理检查的时候要注意，有没有幼稚的细胞或者恶变的细胞，这种情况需要进行广泛的肿瘤切除。因此，内生性软骨瘤有些会成为恶变癌症的情况，因此需要检查清楚，对症治疗。
