功能性腹泻，可以口服抗胆碱能药物，或肠道钙通道阻滞剂，如：匹维溴胺等，调理肠道功能，缓解腹泻。还可选择肠道微生态制剂，如：复方嗜酸杆菌、双歧杆菌、酪酸菌、乳酸菌等，经过调理肠道菌群失调，缓解腹泻症状。还可选择止泻药，如：蒙脱石散、药用炭、肠道吸附止泻药治疗，若症状较重，可选择洛哌丁胺或复方地芬诺酯等止泻治疗。功能性腹泻，和胃肠动力异常、内脏感觉异常、精神心理障碍等因素有关，精神、饮食等因素，常可诱使症状复发或加重，因此，防止诱发症状的食物，建立良好生活习惯。对腹痛、腹泻症状重，经过上述治疗无效，且精神症状明显者，可使用抗抑郁药治疗。
