胎儿脊柱畸形的原因是多方面因素影响的。和遗传因素有关，也和备孕期间或者孕妇在怀孕早期接触了不良的物质，接触了射线，服用了孕妇禁用药，影响了宝宝骨骼的发育。或者是接触了动物及动物的粪便，吃了半生不熟的食物，发生了某些细菌病毒的感染，都有可能造成胎儿脊柱的畸形。如果孕妇在做产检的过程中发现胎儿有脊柱的畸形，这种情况要做胎儿磁共振检查，同时也要征求脊柱外科医生的意见决定宝宝的去留。因为胎儿脊柱的畸形，有可能会影响宝宝以后的生长发育，也有可能要手术治疗。手术治疗有可能损伤脊髓，造成胎儿表现出有瘫痪的情况，因此一定要征求脊柱外科医生的意见来决定宝宝的预后，来决定后续是否继续妊娠。
