门静脉海绵样变性可以通过内镜治疗、介入治疗和外科手术治疗。因为门静脉海绵样变性是指门静脉主干或分支完全栓塞或部分栓塞，而后由其侧枝静脉形成或官腔的再通所引起的肝硬化，长期门静脉阻塞会导致向肝性侧支循环的建立，从而出现食管胃底静脉曲张、破裂出血、脾脏淤血肿大、脾脏功能亢进。一般内镜下的硬化剂注射或者是曲张血管的套扎，主要是用于控制和预防消化道的出血，食管胃底静脉曲张引起的出血。介入治疗也是比较新的方法，对于肝硬化引起的门脉高压具有一定的疗效。外科手术治疗主要是脾切除手术加门体静脉分流术，但是分流手术一般比较复杂，临床应用较少。
