系统性红斑狼疮的病因至今还没有完全清楚。大量研究显示,遗传,内分泌,感染,免疫异常和一些环境因素与该病有关。在遗传因素,环境因素,雌激素水平等各种因素的相互作用下,导致T淋巴细胞减少,另外会导致T淋巴细胞出现功能的下降,B细胞过度增生,导致产生大量自身抗体,并且与体内相应的自身抗原结合。形成相应的免疫复合物沉积在皮肤,关节,小血管,肾小球等部位,在补体的参与下,引起急慢性的炎症。以及组织坏死或者抗体直接与组织细胞的抗炎作用,引起细胞破坏,这种情况就会导致机体的多系统损害。所以就目前来看,系统性红斑狼疮发生的原因不清楚,主要属于自身免疫性疾病跟遗传、感染、免疫异常都有很大的关系。