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引起下消化道出血的病因很多，大致可分为肠道原发性疾病所致的出血和全身性疾病累及肠道所致的出血。肠道原发性疾病包括：
一、肿瘤和息肉，如癌、恶性淋巴瘤、平滑肌瘤、结肠息肉等等。
二、炎症性病变，例如肠结核、肠伤寒、菌痢、细菌性肠炎等。
三、血管性病变，如血管瘤、毛细血管扩张症、血管畸形等。
四、肠壁结构性病变，如憩室、肠气囊肿病、肠套叠等。
五、肛门病变如痔和肛裂。全身性疾病累及肠道，例如白血病、风湿性疾病、淋巴瘤、尿毒症等等。据统计，引起下消化道出血最常见的原因为大肠癌和大肠息肉。肠道炎症性病变次之，其中肠伤寒、肠结核、溃疡性结肠炎、克罗恩病和坏死性小肠炎有时可发生大量出血。不明原因的出血虽然少见，但诊断困难。
