自闭症通常叫做孤独症，病因尚不明确，可能与遗传因素、脑结构功能异常、神经生化因素、免疫学因素等有关。
1.遗传因素
若父母双方或一方患有孤独症，下一代患病风险高于正常人群，且同卵双生子同病率较高。
2.脑结构功能异常
小脑蚓部小叶发育不良、小脑萎缩、海马体缩小等导致中枢神经系统异常，诱发孤独症。
3.神经生化因素
体内5-羟色胺、高香草酸、5-羟吲哚乙酸等水平增高，影响神经发育及其功能，可引起孤独症。
4.免疫学因素
体内免疫细胞数量减少，导致免疫下降，易受到致病菌感染，引起中枢神经损伤，导致发病。
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