甲营养不良不是一个特异性疾病，发病原因包括遗传性和先天性因素以及皮肤疾病、甲单位肿瘤、系统性疾病、局部物理损伤、药物、化学性接触等后天性因素。
1、遗传性和先天性因素
多种遗传性皮肤病会出现甲缺陷，还会伴有其他器官的发育异常，如皮肤、牙齿、骨骼等。胎儿时期血管性、机械性损伤、感染等因素也会导致先天性甲营养不良。
2、皮肤疾病
银屑病、湿疹、扁平苔藓、毛发红糠疹、甲癣、手足口病等疾病会导致甲营养不良。
3、甲单位肿瘤
鳞状细胞癌、血管球瘤、角化棘皮瘤、恶性黑色素瘤等肿瘤会导致甲受损，引发甲营养不良。
4、系统性疾病
贫血、系统性硬皮病、甲状腺功能异常、红斑狼疮等疾病也容易引起该病的产生。
5、局部物理损伤
咬甲癖、剔甲癖、外伤、冻伤、烧伤等情况会造成指甲损伤，从而造成甲营养不良。
6、药物
长时间使用化疗药物、维A酸类药物、砷剂等都可能会引起甲营养不良。
7、化学性接触
长期接触有机溶剂、酸碱等物质也会引发甲营养不良。
