阴道闭锁考虑是胚胎发育过程中泌尿生殖窦和苗勒管末端发育畸形，导致阴道下段缺失引起的。
但是泌尿生殖窦和苗勒管末端发育畸形的病因尚不明确，可能与孕妇孕期服用禁忌药物、受到电离辐射、受到猛烈撞击等原因而导致胎儿发育异常，从而导致阴道闭锁。
根据阴道闭锁的程度，可以分为I型阴道闭锁、II型阴道闭锁。I型阴道闭锁指的是阴道下段闭锁，但是阴道上段、宫颈、宫颈的功能均正常。II型阴道闭锁指的是阴道完全闭锁，通常合并宫颈发育不良、子宫畸形等情况。
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