心脏黏液瘤病因不明，可能是由于遗传因素引起的。
遗传因素是引发心脏黏液瘤形成的基本病因。患者的亲属中存在心脏黏液瘤家族史时，其可能会遗传致病基因，造成其心脏内膜下的原始间叶细胞逐渐向心腔内突出，形成凸起的肿块，进一步引发心脏黏液瘤的形成。
高油高盐饮食、长期吸烟史等不良的生活习惯是导致患者发生心脏黏液瘤的危险因素，因此其应该养成良好的生活习惯，预防疾病的发生。
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