子宫内膜不典型增生的病因尚未完全明确，考虑是长期雌激素刺激，而体内缺乏孕激素拮抗，使得子宫内膜过度增殖，难以转化为分泌期造成的。
研究表明，子宫内膜不典型增生有一定的遗传倾向。母亲患子宫内膜不典型增生，其女儿患病几率较普通人群高。另外，肥胖、长期服用他莫昔芬、接受雌激素治疗、糖尿病、多囊卵巢综合征等因素，可诱发此病。
子宫内膜不典型增生属于子宫内膜癌前病变，患者需要使用醋酸甲地孕酮、醋酸甲羟孕酮、曲普瑞林等药物或者通过手术来治疗。
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