室间隔膜部瘤主要是由于胚胎发育异常、室间隔缺损等原因引起的。
1.胚胎发育异常
患者处于胚胎时期，出现心脏发育畸形的情况时，可造成其室间隔膜部部分组织较为薄弱，左心室的高压血流长期反复对薄弱的组织产生冲击时，局部可出现瘤样扩张，从而引发室间隔膜部瘤形成。
2.室间隔缺损
患者出现室间隔缺损的情况时，局部组织可受到长期高压冲击，使其出现三尖瓣隔瓣缘和腱索相互粘连的情况，进而导致患者出现室间隔膜部瘤的表现。
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