胰腺异位病因未完全明确，可能是胰腺组织迁移、内皮组织化生、内胚层细胞分化等原因引起的。
1.胰腺组织迁移
处于胚胎时期时，胰腺成分与胰腺主体分离，迁移至发育过程中的胃肠道组织后，可变成成熟的胰腺组织。
2.内皮组织化生
胰腺内皮组织逐渐向黏膜下层迁移时，可转化形成胰腺组织，造成胰腺异位。
3.内胚层细胞分化
发育初始阶段，胰腺胚胎细胞可种植在全身多个部位，在胰腺以外的部位发育后，可导致胰腺异位。
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