蓝痣的发生可能与黑色素细胞异位、基因突变、外伤刺激等原因有关。
1、黑色素细胞异位
胚胎发育期间，黑素细胞可从神经嵴向表皮部位移动，黑素细胞发生异位的情况后，可在真皮内聚集、停留，形成蓝痣。
2、基因突变
蛋白质GNAQ和GNA11被激活，发生突变的情况时，光照透过皮肤可被黑素吸收，短波被皮肤散射折回后，可导致蓝痣发生。
3、外伤刺激
局部皮肤受到创伤，形成皮损后，可能会刺激黑素细胞的增生，造成真皮内的黑素细胞增多，引发蓝痣。
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