肾盂肿瘤的病因尚未明确，可能与职业接触、吸烟、遗传、泌尿系相关疾病、药物等因素有关。
1、职业接触
职业性长期接触煤、焦炭、沥青、焦油或芳香胺类物质的人群，出现肾盂肿瘤的风险较高。
2、吸烟
肾盂肿瘤是发生在上尿路上皮的肿瘤，长期吸烟者的发病率较正常人群可高出多倍。
3、遗传
Lynch综合征患者，患肾盂癌的可能性比普通人高。
4、泌尿系相关疾病
反复的尿路结石、慢性尿路炎症会长期刺激尿路上皮，可能会导致其发生恶变。
5、药物
长期服用非那西丁可引起肾损伤、肾衰竭，引起肾盂肿瘤、膀胱癌等。
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